Hraniční kontrolní stanoviště kontroluje dovoz živých zvířat, potravin a původ živočišných produktů ze zemí mimo Evropskou unii (EU). Dovozce musí oznámit příchod zásilky na hraniční kontrolní stanoviště, kde je zboží předmětem prohlídky, ještě před jeho příjezdem.
Vzhledem k rozsáhlým předpisům o zdraví zvířat mohou být celní prohlídky zvířat a produkce živočišných produktů prováděny pouze na pověřených celních úřadech, kterým je přidělen statut hraničního kontrolního stanoviště.
