Speciale monitoring betekent het verzamelen en duurzaam controleren van bepaalde goederen in het douanegebied. Vanwege wettelijke bepalingen zijn sommige categorieën goederen onderworpen aan speciaal toezicht door de douane en de gespecialiseerde autoriteit. Dit toezicht wordt uitgevoerd op het gebied van verboden en beperkingen, buitenlandse handelswetgeving en exportcontrole.